Assessoria Técnica de Integração Fiscal, Operações e Regulação Sanitária
Assessoria de Planejamento e Gestão
Assessoria de Demandas Institucionais
Assessoria de Relações Institucionais e Divulgação
Assessoria de Tecnologias e Sistemas de Informação
Coordenadoria Geral de Inovação, Projetos, Pesquisa e Educação Sanitária (CGIPE)
Coordenadoria Geral de Licenciamento e Fiscalização (CGLF)
Coordenadoria Técnica de Avaliação de Tecnologia em Saúde e Insumos Estratégicos (CTATS)